Несмотря на то, что участок расположен в охранной зоне, окружающая застройка не диктовала средового подхода, а соседство с корпусами знаменитой ткацкой фабрики «Красное знамя» Эриха Мендельсона вдохновляло на эксперименты.

Архитектурный образ здания навеян символами еврейской культуры и в то же время продиктован жёсткими требованиями безопасности, разработку которых курировали эксперты израильских спецслужб. Так, глухая стена вдоль главного фасада не только символизирует западную стену Второго Иерусалимского Храма, но и выполняет защитную функцию. За ней расположен зимний сад-атриум. Там же предусмотрена открытая лестница, связывающая все этажи здания и получившая неофициальное название «лестница Якова». В полукруглой башне размещена библиотека, которая освещается через фонарь с переплётом в виде еврейского символа — семисвечника меноры.

Расположенный в центре здания светлый крытый атриум объединяет помещения различных еврейских общественных организаций. Также в здании есть концертный и спортивный залы. Здание ЕСОД было удостоено премии Правительства Российской Федерации в области культуры за 2006 год.